ESM3.

Modelin ne ile çalıştığı

ESM3 ile eğitim amaçlı tanışma için, yayınlanmış bir açıklama ile açık bir protein dizisi alabilirsiniz. Model, dizi, yapı ve fonksiyonun temsilleriyle çalışır. Bu, aralarındaki bağlantıları hesaplamalı olarak değerlendirmemizi sağlar. Başlamadan önce, seçilen SDK seçeneğinin hangi alanları desteklediğini belirtin. Doğrulama için, orijinal dizinin bilindiği ve sonucun konuma göre karşılaştırılabileceği küçük bir örnek uygundur.

Bilinen bir örneği kontrol edin

Birkaç pozisyonu işaretleyin ve öngörülen model çıktısını orijinal setle karşılaştırın. Girişte hangi bilgilerin mevcut olduğunu yazın. Yapı verileri eklerseniz, bu çalışmayı yalnızca dizi halinde çalışmadan ayrı tutun. Karşılaştırma, farklılıklar olduğunda bile ilginçtir. Hesaplama tahmininin diğer girdilerle nasıl değiştiğini gösterir ve kütüphanenin formatı doğru okuduğunu kontrol etmeye yardımcı olur.

Sonuç nasıl okunur

Sürüm kimliğini, parametrelerini ve verinin kaynağını kaydedin. Bir karakteri veya dizideki başka bir sürümü kaçırmanın model hatası gibi görünmemesi için pozisyonların numaralandırılmasını doğrulayın. Birkaç örnek için bir değerlendirme gerekiyorsa, farklı özelliklere ve bilinen bir notaya sahip girdileri seçin. Model çıktısı bu veriler üzerinde hesaplamalı gözlem olarak tanımlanmalıdır. Protein özellikleri ve gerçek dünya çalışmalarına uygulanabilirlik, bağımsız kaynaklar ve ayrı doğrulama gerektirir. Maçları başlangıç koşullarıyla birlikte açıklayın, böylece başka bir okuyucu karşılaştırmayı tekrarlayabilir.

Hangi görevler uygun

• Gizli pozisyonların kamuya açık dizilimdeki geri kazanımını inceleyin
• Model çıktısını açıklamalı verilerle karşılaştırın