ESM3.

Ce que fait le modèle

Pour une introduction à ESM3, vous pouvez prendre une séquence de protéines ouvertes avec une annotation publiée. Le modèle fonctionne avec des représentations de séquence, de structure et de fonction. Cela vous permet de voir les liens entre eux de manière informatique. Avant de lancer, spécifiez les champs pris en charge par la version SDK sélectionnée. Un petit exemple est pratique pour la vérification, dans lequel la séquence initiale est connue et le résultat peut être comparé à elle par position.

Vérification par un exemple connu

Cochez plusieurs positions et comparez la sortie prévue du modèle à l'ensemble d'origine. Notez les informations qui sont restées disponibles à l'entrée. Si vous ajoutez des données de structure, gardez cette course séparée de la course uniquement par séquence. La comparaison est intéressante, même en cas de divergences. Il montre comment la prédiction informatique a changé avec d'autres entrées et aide à vérifier que la bibliothèque a bien lu le format.

Comment lire le résultat

Enregistrez l'ID de version, les paramètres et l'origine des données. Vérifiez la numérotation des positions afin que l'omission d'un caractère ou une autre édition de séquence ne ressemble pas à une erreur de modèle. Si vous avez besoin d'une note pour plusieurs exemples, choisissez des entrées avec des caractéristiques différentes et une annotation bien connue. La sortie du modèle doit être décrite comme une observation computationnelle de ces données. Les propriétés des protéines et leur applicabilité à la recherche réelle nécessitent des sources indépendantes et une vérification distincte. Décrivez les correspondances avec les conditions initiales afin qu'un autre lecteur puisse répéter la comparaison.

Pour quelles tâches convient-il

• Explorer la restauration des positions cachées dans la séquence publique
• Comparer la sortie du modèle avec les données annotées